بررسی مقالات در نشریه بوم شناسی جنگل های ایران دارای سه مرحله اصلی است:
۱- داوری اولیه
۲- داوری نهایی
۳- تایید نهایی سردبیر و صدور نامه پذیرش
داوری اولیه مقالات به سه بخش تقسیم شده است. بخش اول به مدت ۲۴ تا ۴۸ ساعت شامل بررسی: نگارش متن (تایپ)، چیدمان مقاله، رعایت نکات ذکر شده در راهنمای نویسندگان و مدارک ارسال شده است. در بخش دوم از مرحله داوری اولیه، مقاله به دبیر تخصصی (متخصصین با تجربه و شناخته شده در رشته مربوطه) ارجاع می شود. دبیر تخصصی ظرف مدت ۵ روز مقاله را به طور کلی بررسی کرده و سوالات زیر را پاسخ خواهد داد.
در صورتی که مقاله از نظر دبیر تخصصی مناسب تشخیص داده نشود از روند بررسی حذف می شود. با تایید دبیر تخصصی مقاله وارد بخش سوم از مرحله داوری اولیه می شود. در این بخش مقاله جهت بررسی بیشتر به حداقل سه داور متخصص (منتخب هیات تحریریه) در زمینه مربوطه ارسال می شود. بعد از اظهار نظر داوران و به شرط نظر مساعد داوران، مقاله جهت بازنگری به نویسنده ارجاع شده و مرحله داوری اولیه به اتمام می رسد.
برای انجام داوری نهایی لازم است نویسندگان ظرف مدت یک هفته، مقاله را تصحیح نمایند. در نشریه بوم شناسی جنگل های ایران، مقالاتی که در مهلت تعیین شده تصحیح و ارسال می شوند در اولویت بررسی و نهایتا چاپ قرار خواهند گرفت. اگر مرحله ارسال نسخه تصحیح شده (بعد از داوری) بدون بازگشت به نویسنده (جهت تصحیح و رعایت موارد مندرج در راهنمای نویسندگان) سپری شود در آن صورت روند بررسی مقاله تسریع و در مدت چند هفته وضعیت آن نهایی خواهد شد. در آخرین مرحله (داوری نهایی) نسخه تصحیح شده مقاله توسط داوران منتخب بررسی و نهایتا توسط سردبیر تایید و تعیین تکلیف خواهد شد.